T. Seiskari - Mikrobiologian lyhyt oppimäärä

11.5.2016
MIKROBIOLOGIA
- lyhyt oppimäärä
Tapio Seiskari
10.5.2016
mikrobiologia
•
•
•
•
•
Bakteriologia
Virologia
Mykologia
Parasitologia
Immunologia
1
11.5.2016
gramvärjäys
+ kokki (kokkos =”marja”)
Staphylococcus
Streptococcus
- sauva
+ sauva
- kokki
hiiva
käsitteitä
•
•
•
•
Normaalifloora
Sekafloora
Kolonisaatio
Infektio
2
11.5.2016
Normaalifloora
• Anatomiselle alueelle tyypillisiä bakteerilajeja.
• Vaihtelee huomattavasti anatomian mukaan.
– Nielu: Streptococcus viridans, Neisseria ssp., Streptococcus
pneumoniae, Actinomyces ssp, Haemophilus ssp…
– Iho: Staphylococcus ssp., Corynebacterium ssp.,
Propionibacterium acnes…
– Suolisto: enterobakteerit, anaerobit…
• Voi sisältää potentilaalisia taudinaiheuttajia, mutta
tällaisen löytyminen ei aina ole osoitus taudista.
Figure 6. OTU richness estimates for each body site.
Huse SM, Ye Y, Zhou Y, Fodor AA (2012) A Core Human Microbiome as Viewed through 16S rRNA Sequence Clusters. PLoS ONE 7(6): e34242.
doi:10.1371/journal.pone.0034242
http://journals.plos.org/plosone/article?id=info:doi/10.1371/journal.pone.0034242
3
11.5.2016
sekafloora
= ”Sekakasvua”
• Useita bakteerilajeja.
• Ei normaaliflooraa.
• Esim.: Iholla haava muuttaa bakteerien
kasvuolosuhteita à haava voi kolonisoitua
bakteereilla, jotka eivät ole ihon
normaaliflooraa à sekafloora
kolonisaatio
• Mikrobin lisääntyminen ilman tautia.
• Voi olla osana normaaliflooraa tai sekaflooraa.
• Esim. MRSA nenän limakalvolla.
Kuva: yskösviljely
4
11.5.2016
infektio
• Mikrobi lisääntyy aiheuttaen taudin.
Kuva: pintamärkä, peräaukko
”super bugs”
• Useille mikrobilääkkeille resistentit bakteerit
5
11.5.2016
mikrobilääkeresistenssi
• Bakteerilajille luontaista
• Hankittua (=siirtyvää)
• Hoidollinen ongelma?
• Sairaalahygieninen ongelma?
Luontainen mikrobilääkeresistenssi
• Enterokokit ovat luonnostaan resistenttejä
esim. kefalosporiineille.
• Pseudomonas aeruginosa on luonnostaan
resistentti kefuroksiimille ja keftriaksonille.
• Aiheuttaa hoidollisia haasteita
6
11.5.2016
Escherichia coli
Pseudomonas aeruginosa
Enterococcus
Luontainen, indusoituva
• Monilla enterobakteerilajeilla (Enterobacter
ssp., Citrobacter ssp….) on kromosomaalinen
beetalaktamaasi (=AmpC)
à Resistenssi kaikille kefalosporiineille, myös
piperasilliini-tatsobaktaamille.
• Hoidollinen ongelma.
7
11.5.2016
Hankittu resistenssi
•
•
•
•
ESBL
Karbapenemaasin tuottajat, esim. KPC
VRE
MRSA
• Hoidollinen haaste ja sairaalahygieninen
ongelma.
P. aeruginosa
K. pneumoniae, KPC
8
11.5.2016
ESBL: E. coli, K. pneumoniae… ,
onko näillä eroja?
Huom: E. coli on kuitenkin väestössä selkeästi yleisin ESBL-enterobakteeri.
9
11.5.2016
The overall contamination rate was 3.4%
(38/1104) and was significantly higher for
ESBL-KP than ESBL-EC (5.4%
versus 0.4%; p < 0.0001).
Ympäristökontaminaatio: MRSA
10
11.5.2016
Ympäristökontaminaatio – vertailu
bakteerilajeittain
MRSA
10x
arvio
ESBL-Kp
10x
arvio
ESBL-Ec
Pointti I
• Mikrobilöydöksen merkitystä arvioidaan
bakteerilajin, anatomian ja kliinisten
esitietojen perusteella.
11
11.5.2016
Pointti II
• Resistenttien bakteerien löytyminen
sairaalaympäristöstä haastaa käsityksemme
siivouksen riittävyydestä.
Pointti III
• Resistenteillä bakteereilla on eroja.
• Hankittu (siirtyvä) resistenssi ympäristöön
tehokkaasti leviävillä bakteereilla on erityisen
huono asia sairaalahygienian kannalta.
12
11.5.2016
Kiitos!
13