2D-Gel - SERVA Electrophoresis GmbH
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2D-Gel - SERVA Electrophoresis GmbH
News Kundenzeitschrift der SERVA Electrophoresis GmbH 2D-GelElektrophorese SERVAGel ™ Fertiggele Jetzt auch mit 10 Probetaschen SERVA ICPL™ Quadruplex Kit Jetzt mit viertem Label Trypsin NB Jetzt mit internem Standard Herbst 2008 4 -7 G roßformatige 2D-Gelelektrophorese Dreamteam SERVA-Hoefer 8-10 D IAS II Geldokumentation und Auswertung 11 B 2 lue Marine HTS Variables Submarine DNA-Elektrophorese-System Inhalt 12 -13 S ERVAGel ™ Jetzt auch mit 10 Probetaschen 14 -15 S ERVA ICPL™ Quadruplex Kit T rypsin NB S ingleQuant Jetzt mit viertem Label 16 Jetzt mit internem Standard 17 Zur Bestimmung der Proteinkonzentration 18 -19 S ERVALYT ™ PRECOTES™/PreNets™ und Blank PRECOTES™/PreNets™ Fertiggele für die horizontale Isoelektrische Fokussierung 3 G roßformatige 2D-Gelelektrophorese: Dreamteam SERVA-Hoefer Für beste Ergebnisse in der großformatigen 2D-Gelelektrophorese: I. Von SERVA IPG-Streifen, 2D-Marker sowie Reagenzien (Gel- und Puffer-Lösungen, Färbekits) II. Von Hoefer die Elektrophorese-Einheit IEF100 für die Fokussierung der IPG-Streifen (1. Dimension) sowie die SE 900 Vertikale Elektrophorese-Kammer für die anschließende SDS PAGE (2. Dimension). 1. Dimension: Isoelektrische Fokussierung Hoefer IEF100 IEF-Elektrophoresegerät Zur Trennung Ihrer Proteinprobe Die IEF100-Einheit hat die Kapazität für mittels SERVA IPG BlueStrips in der sechs IPG-Streifen mit Längen zwischen ersten Dimension empfehlen wir den 7 und 24 cm. Das Gerät ist mit einem Einsatz der Hoefer-Einheit IEF100. integrierten 12.000 Volt Netzgerät sowie Damit können Sie die Isoelektrische einem Peltier-Element zur Kühlung der Fokussierung schnell, einfach und Streifen ausgestattet, der Fokussierungs- reproduzierbar durchführen. tray ist reversibel mit der Kühlplatte verbunden. Die Proben können wahlweise per Cup-Loading oder durch Rehydratation aufgetragen werden. IEF-Protokolle sind leicht zu programmie- Lieferumfang (Kat.-Nr. IEF100) ren und auszuwählen, die Bedienung ist 1 IEF100-Einheit • 1 Lauf- und Rehydratationstray 10 Cup-Sets (à 6 Cups) • 1 Packung Elektrodendochte (252 Stk.) 1 Pinzette • 1 Reinigungsbürste einfach und intuitiv. Dank der hohen Leistung des Netzgeräts ist die IEF in vergleichbar kurzer Zeit bei bester Spezifikationen Volt: 12.000 V • Ampere: 10 mA Auflösung: 1 μA Temperaturbereich: 15 – 25 °C Cup-Volumen: 240 μl Abmessungen (B x H x T): 38 x 19 x 27 cm Gewicht: 6 kg Schnittstellen: Ethernet, RS232 Trennung durchgeführt. Über das Display können Sie jeden einzelnen Streifen in Echtzeit monitoren (grafisch, tabellarisch). Auf dem Bildschirm können Sie das komplette IEF-Protokoll jedes einzelnen Streifen ablesen, die Daten können bei Bedarf über die an der Front leicht zugängliche Produkt Kat.-Nr. Menge Preis IEF100 Unit IEF100 1 Gerät 7.450,00 a 4 Schnittstellen (Ethernet, RS232) ausgelesen werden. SERVA IPG BlueStrips SERVA IPG BlueStrips sind getrocknete Gelstreifen mit immobilisiertem pH-Gradienten für die hochauflösende 2D-Gelelektrophorese von Proteinen. Zur Stabilisierung des Gels ist die homogene Polyacrylamid-Gelmatrix kovalent an die Trägerfolie GEL-FIX™ gebunden. Bis zum Gebrauch ist die Oberfläche der Gelmatrix zusätzlich durch eine Deckfolie (GEL-FIX™ for Covers) geschützt. Alle Gelstreifen einer Packung stammen aus einer Produktionscharge. Jeder SERVA IPG BlueStrip trägt seine individuelle Lot-Nummer. Dies ermöglicht den GLP/GMP-konformen Einsatz der SERVA IPG BlueStrips. Gelagert bei -20 °C sind die Gelstreifen mindestens 18 Monate haltbar. Jede Packung enthält 12 Gelstreifen mit jeweils 3 mm Breite. Die Gelstreifen sind in den pH-Gradienten 3 – 10, 3 – 10 NL, 3 – 6, 4 – 7 und 6 – 10 sowie in den Längen von 7 cm, 18 cm und 24 cm erhältlich. pH-Gradient Länge 7 cm Länge 18 cm Länge 24 cm SERVA IPG BlueStrips (12 Streifen) 3 – 10 3 – 10 NL 3–6 4–7 43001.01 43002.01 43005.01 43003.01 43011.01 43012.01 43015.01 43013.01 43021.01 43022.01 43025.01 43023.01 Preis 6 – 10 43004.01 57,00 a 43014.01 80,00 a 43024.01 92,50 a pH-Gradient Kat.-Nr. Recommended for rehydration: SERVALYT™, 2 ml 3 – 10 3 – 10 Iso-Dalt for 2D 3–6 4–7 42940.04 42951.04 42944.04 42948.04 Preis 6–9 42913.04 35,00 a Nach einer aktuell getroffenen Vereinbarung wird Hoefer Inc., USA, ab sofort die SERVA IPG BlueStrips weltweit vertreiben. Für Sie bedeutet das, dass Sie von den im Rahmen dieser starken Partnerschaft gemachten Erfahrungen im weltweiten Einsatz der SERVA IPG BlueStrips in SERVA und Hoefer – eine starke Allianz. Kombination mit dem Hoefer 2D-System profitieren. www.serva.de 5 G roßformatige 2D-Gelelektrophorese: Dreamteam SERVA-Hoefer 2. Dimension: SDS PAGE Hoefer SE900 Vertikale Slabgel-Elektrophoresekammer Führen Sie mit der SE900 hoch- Jetzt können die Gele einfach in die reproduzierbare SDS-Polyacrylamidgel- bereits mit Laufpuffer gefüllte Kammer elektrophorese durch. Nach erfolgter eingesetzt werden. Dank der Konstruk- Isoelektrischer Fokussierung können Sie tionsweise der Kammer (Iso-Dalt-Design) die auf IPG-Streifen getrennten Proben existiert keine obere Pufferkammer, es nun in der 2. Dimension auf Gelen im gibt keine Dichtigkeitsprobleme und der Format 25 x 20 cm trennen. Puffer kann wieder verwendet werden. Dies minimiert den Pufferverbrauch Die SE900-Einheit fasst sechs vertikale erheblich. Eine gleichmäßige Tempera- Gele, die Laufrichtung ist horizontal. Zur tur für reproduzierbare Ergebnisse wird einfachen Handhabung sind die groß- durch eine externe Kühlung kombiniert formatigen Glasplattenkassetten fertig mit interner Pufferzirkulation erzielt. mit Spacer montiert und über ein Gelenk Nach erfolgter Elektrophorese kann die miteinander verbunden, die Glasplatten Kammer einfach über eingebaute sind auch als „Low-Fluorescence“-Gläser Ablasshähne geleert werden. erhältlich. Nach gleichzeitigem Gießen von bis zu sechs Gelen im Gelgießstand werden die fokussierten IPG-Streifen auf die 2D-Tasche aufgelegt und mit Agarose fixiert. Dies gewährleistet einen optimalen Übergang von der ersten in die zweite Dimension. Spezifikationen Glasplattengröße (B x H): 28 x 21 cm Gelgröße (B x H): 25 x 20 cm Wattmax.: 100 W • Voltmax.: 600 V • Amperemax.: 1000 mA Temperaturmax.: 45 °C • Gewicht: 13,6 kg Geräteabmessungen (B x H x T): 43 x 43 x 20 cm Lieferumfang (Kat.-Nr. SE900-1.0) Großformatiges PAGE System 6 Glaskassetten Gelgießstand komplett Lieferumfang (Kat.-Nr. SE900) Großformatiges PAGE System ohne Zubehör Produkt Kat.-Nr. Menge Preis SE900 Vertical Slab Gel Electrophoresis Unit, Complete SE900-1.0 1 System 6.250,00 a SE900 Vertical Slab Gel Electrophoresis Unit SE900 1 System 4.800,00 a SERVA 2D Proteome Marker Proteine Der SERVA Proteome Marker ist eine Geliefert wird der SERVA Proteome Mischung aus acht unterschiedlichen Marker als Kit mit 5 Vials, jedes Vial Proteinen, ausgewählt unter besonderer enthält ausreichend Protein für 5 bis Hinsicht auf die Eignung im Einsatz 10 Anwendungen. in der 2D-Gelelektrophorese sowie für pl = > LC/MS-Anwendungen. Die in äquimolaren Mengen vorliegenden Proteine decken den gesamten physiologischen pH-Bereich ab und besitzen MolekularMit freundlicher Genehmigung der Deutschen Gesellschaft für Proteomforschung (DGPF). Erstmals vorgestellt im Rahmen der „10. Arbeitstagung Mikromethoden in der Proteinchemie“ (2003, Martinsried) gewichte zwischen 11,7 und 77 kDa. Die Entwicklung des SERVA Proteome Marker erfolgte in enger Zusammenarbeit mit der Deutschen Gesellschaft für Proteomforschung (DGPF). Produkt Kat.-Nr. Menge Preis SERVA Proteome Markers 39220.01 1 Kit 245,00 a SERVA Reagenzien • Nach erfolgter Elektrophorese können Für die 2. Dimension bietet SERVA gebrauchsfertige Reagenzien, mit denen Sie die Gele entweder mit SERVA Sie in Kombination mit der SE900 Elek- Blue R oder der MS-kompatiblen trophoreseeinheit von Hoefer garantiert SERVA Densi Stain Blue G Färbelösung beste Trennergebnisse erzielen: färben, eine deutlich sensitivere Alternative ist die ebenfalls MSkompatible SERVA-Silberfärbung. • Zur Herstellung der Gele eignen sich am besten die 40-prozentige Acrylamid/ Bisacrylamid Lösung 37,5:1 sowie TEMED, APS. Verwenden Sie zur Fixierung der IPG-Streifen „Agarose SERVA for DNA Electrophoresis“ und für die Elektrophorese LaemmliLaufpuffer. Produkt Acrylamid / Bisacrylamide-Solution, 37.5:1 (40 % w/v; 2.6 C) TEMED APS Agarose for DNA Electrophoresis 10 x Laemmli Buffer SERVA DensiStain Blue G Staining Solution, 2fold concentrate SERVA Blue R Staining Kit SERVA Silver Staining Kit SDS PAGE www.serva.de Kat.-Nr. Menge 10681.02 4 x 500 ml 35930.02 13375.05 11404.07 42556.01 25 ml 250 g 500 g 2l 35078.01 500 ml 42531.01 1 Kit 35076.01 1 Kit Preis 96,00 a 18,50 a 13,00 a 295,00 a 47,50 a 89,00 a 76,00 a 115,00 a 7 D IAS II – Geldokumentation und Auswertung Das völlig neu konzipierte Geldokumentations- und Gelauswertesystem DIAS II bietet modernste Technik in Bildaufnahme und Auswertung. Zur Erzielung optimaler Ergebnisse besteht das System aus drei Hauptkomponenten: dem Kabinett, einer Digitalkamera sowie der 1D-Auswertesoftware. Das Kabinett Die Kamera Vollständig aus Stahl gefertigt, extrem Bei der für dieses System ausgewählten stabil und widerstandsfähig im alltäg- Digitalkamera handelt es sich um die lichen Einsatz, dank optimaler Gehäuse- Canon PowerShotG9. Diese Kamera dimensionen und Design aber dennoch liefert gerade in der Geldokumentation leicht und gut handhabbar. Und licht- die besten Ergebnisse, insbesondere dicht. Die großformatige Tür und die unter der Beachtung der Daten, die bei leichtgängige Schiebevorrichtung für anschließender qualitativer und quantita- einen Transilluminator erlauben ein tiver Auswertung erzielt werden. Die einfaches Handhaben der Gele oder Kamera ist fest in das System integriert, anderer Objekte. Neben einem UV- oder die Bedienung erfolgt ausschließlich Weißlicht-Transilluminator kann das PC-gesteuert (PC ist nicht im Lieferum- Kabinett mit kombiniertem UV/Weißlicht- fang enthalten), die gewonnenen Bilder Auflicht sowie mit reinem Weißlicht- bzw. Daten werden ebenfalls direkt auf Auflicht ausgestattet werden. Im Liefer- den Rechner übertragen. umfang enthalten ist ein Filterhalter mit eingebautem UV-Filter. Die Beleuchtungselemente sind einfach und sicher von außen zu bedienen. • Anwendungsoptimiertes Design • Stabiles, leichtes Gehäuse • Großformatige Tür • Einfache Handhabung der Gele / Objekte • Lichtdicht • Geringer Platzbedarf • Komplett von außen bedienbar 8 • 12.1 Megapixel • JPEG, TIFF oder RAW-Format • Bis ISO 1600 • 6fach optischer Zoom mit Bildstabilisator • Steuerung und Speicherung über externen PC (nicht im Lieferumfang enthalten) Die Software Die 1D-Auswertesoftware GelScan 6.0 Zusätzlich zum Lieferumfang gehört ermöglicht Ihnen die einfache, zuverläs- GelScript 1.1, die Sie bei der Beschrif- sige und umfassende Auswertung Ihrer tung und Präsentation von Abbildungen DNA-, RNA- oder Proteingele einschließ- unterstützt. In erweiterten Versionen lich des Exports der Daten in MS-Anwen- ist GelScan als Pro und HTS dungen wie Word , Excel oder Power- verfügbar (s. u.). ™ ™ Point . Banden werden automatisch ™ detektiert, manuelle Änderungen sind jederzeit möglich. Eine dreidimensionale GelScan 6.0 können Sie vier Wochen als Darstellung erleichtert das Abgrenzen Vollversion ohne Einschränkung testen der Banden untereinander. Überbelich- (Download siehe www.serva.de). tete Gele werden korrigiert, Gele lassen sich transparent übereinander legen oder nebeneinander berechnen. Das GLP-konforme Programm erstellt zudem zu jedem Bild im Hintergrund automatisch eine lückenlose Historie und damit ein unveränderbares Protokoll einschließlich Benutzername, Datum sowie aller durchgeführten Kalkulationen und Manipulationen. www.serva.de 9 D IAS II – Geldokumentation und Auswertung Molekulargewichtsbestimmung, Mögliche Erweiterungen Quantifizierung und Expressions- In der Pro-Version können zusätzlich analyse RFLP-Gele ausgewertet oder Cluster- Bei der Bestimmung von Molekular- Analysen durchgeführt werden. Die gewicht oder isoelektrischem Punkt HTS-Version verfügt darüber hinaus können vorhandene Standards genutzt über die Möglichkeit, datenbankgestützt oder benutzerdefinierte Standards ein- Gele in Hochdurchsatz-Anwendungen gesetzt werden, selbst schief laufende mit bis zu 480 Spuren je Gel auszuwer- Spuren können ausgewertet werden. ten (Molekulargewichtsanalysen, Ex- Mithilfe eines bekannten Mengenstan- pressionsanalysen, Quantifizierungen). dards können DNA- oder Proteinmengen je Bande berechnet werden. Dank des ebenfalls im Programm enthaltenen Moduls zur Expressionsanalyse kann durch Vergleich des Bandenmusters in • Bestimmung des Molekulargewichts (MW) unterschiedlichen Gelen die An- bzw. • Bestimmung des isoelektrischen Punkts (pI) Abwesenheit einer Bande und damit • Quantifizierung eines Proteins oder bestimmten DNA- • Expressionsanalyse Fragments automatisch ermittelt werden. • Automatische Bandendetektion, editierbar GelScript 1.1 • Automatische Hintergrundreduktion, editierbar Mit der zum Lieferumfang gehörenden • Datenexport in MS-Anwendungen Gelscript 1.1 Software erstellen Sie in wenigen Minuten professionelle Gelbeschriftungen und bereiten so Ihre Abbildungen für Präsentationen und • GLP-konform • In der Pro-Version mit RFLP und Clusteranalyse Publikationen vor, alle Abbildungen sind • In der HTS-Version zusätzlich für Hochdurchsatz-Anwendungen frei skalierbar. Neben Werkzeugen zur • GelScript 1.1 zur Bildbeschriftung Banden- und Spurenbeschriftung können Sie zudem mit Hilfe von Separationslinien unterschiedlichste Banden und Spuren in einer Abbildung zusammenfügen. Produkt Kat.-Nr. Digital Imaging and Analysis System II DIAS-II GelScan 6.0 GSV60 10 Menge 1 System 1 System Preis 4.950,00 a 1.650,00 a B lueMarine HTS – Variables Submarine DNA-Elektrophorese-System Die neue Submarine-Elektrophorese- Auswertung der Gele nach kammer BlueMarine HTS bietet Ihnen Hochdurchsatzanwendung ein neu entwickeltes, flexibles System Zur Auswertung von Gelen mit 102 zur DNA-Analytik. Probentaschen können Sie die auf Ob Einzelproben mit langer Laufstrecke Seite 10 beschriebene 1D-Software oder komplette 96-Well-Mikrotiterplatten, GelScan HTS einsetzen. Die Software BlueMarine HTS bietet eine schnelle, erkennt alle Spuren im Gel automatisch übersichtliche Analytik für bis zu 102 und ordnet sie zu einer vereinfachten Proben inkl. Größen- oder Mengenstan- Analyse nebeneinander an. Dies ermög- dards. Mit der BlueMarine HTS haben licht eine rasche und unkomplizierte Sie ein System, das darüber hinaus in Auswertung des Gels in allen drei Modi: Verarbeitung und Material höchsten Expressionsanalyse, Größen- sowie Ansprüchen gerecht wird. Mengenbestimmung. Beim Gießen des Gels im UV-durchlässigen Gelträger aus Acryl können Sie an sechs unterschiedlichen Positionen Kämme einsetzen. Die Kämme sind aus Aluminium gefertigt und dadurch absolut formstabil und unverwüstlich, jeder Kamm bildet 17 Probentaschen aus. Durch eine unterschiedliche Links-/Rechts-Orientierung des Kamms können Sie wahlweise die Probentaschen übereinander oder versetzt anordnen. Durch eine versetze Anordnung und bei Einsatz aller Kämme erhalten Sie 102 Spuren mit einer jeweiligen Trennstrecke von 3 cm. • Flexible Anordnung der Probentaschen • Flexible Trennstrecken • Gelformat (B x L): 175 x 192 mm für max. 102 Proben • Geräteabmessung (B x L x H): 195 x 380 x 80 mm • Inkl. sechs unverwüstlichen Kämmen aus Aluminium Produkt BlueMarine HTS GelScan 6.0 HTS Kat.-Nr. BM-HTS GS-V60HTS Menge 1 System 1 Software Preis 1.095,00 a 2.900,00 a 11 S ERVAGel ™ – Jetzt auch mit 10 Probentaschen Ab sofort bietet SERVA das SERVAGel ™ Fertiggel für die vertikale Elektrophorese im Minigelformat (10 x 10 cm) auch mit 10 Probentaschen an. Ihr Vorteil: ein mit 50 μl im Vergleich zu Daneben sind Neutralgele (pH 7.4) mit 35 μl bei Gelen mit 12 Probentaschen breitem Trennbereich vergleichbar den größeres Probenvolumen. Wählen Sie Gradientengelen erhältlich. Diese Gele jetzt je nach Anwendung zwischen Gelen zeichnen sich durch deutlich längere mit 10 oder 12 Probentaschen oder mit Lagerfähigkeit ohne Qualitätsverlust aus 2D-Probenauftrag. (> 1 Jahr). SERVAGel ™ Fertiggele sind in form- Wählen Sie jetzt je nach Ihrer Protein- stabile Kassetten im Format 10 x 10 cm probe zwischen 24 unterschiedlichen gegossen. Sie sind als Tris-Glycin-Gele Geltypen. Sollten Sie dennoch für Ihre in homogenen Acrylamid-Konzen- Anwendung einen davon abweichenden trationen sowie mit Konzentrations- Geltyp benötigen, fragen Sie uns. Durch gradienten verfügbar. unsere flexible Produktionsanlage können wir schnell und dennoch in gewohnt hoher Qualität Gele nach Ihren Anforderungen herstellen. Fragen Sie uns, am einfachsten per E-Mail (Tech.Service@serva.de) oder per Telefon (+49 6221 13840-44). SERVAGel ™ Fertiggele: Trennbereiche Gel Typ* 5 25 50 75 100 TG 8% TG 10% TG 12% TG 14% TG 16% TG 4 –12 % TG 8 –16 % TG 4 –20 % 2D 10% 2D 12% 2D 14% 2D 8 –16% N pH 7.4 NG pH 7.4 * TG * 2D 12 = Tris-Glycine = 2-Dimensional *N * NG = Neutral = Neutral Gradient 150 200 kDa SERVAGel ™: 10 Probentaschen SERVAGel ™: 12 Probentaschen SERVAGel ™: 1 2D-Probentasche • Hohe Trennleistung, leichte Handhabung • Kompatibel mit Hoefer Mini Vertikalsystemen SE260 und SE300 • Kompatibel mit Vertikalsystemen weiterer Hersteller • Regelmäßige Lieferung nach Terminvereinbarung (Abo) möglich • Fertigung nach Kundenwunsch möglich SERVAGel ™ Tris-Glycin Gele – homogen Kat.-Nr. 43209.01 SERVAGel ™ Tris-Glycine 8 % 43208.01 43211.01 SERVAGel ™ Tris-Glycine 10 % 43210.01 43213.01 SERVAGel ™ Tris-Glycine 12 % 43212.01 43215.01 SERVAGel ™ Tris-Glycine 14 % 43214.01 43217.01 SERVAGel ™ Tris-Glycine 16 % 43216.01 Probentaschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen Menge 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele Preis 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a SERVAGel ™ Tris-Glycin Gele – Gradient Kat.-Nr. 43238.01 43232.01 43236.01 43230.01 43237.01 43231.01 Probentaschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen Menge 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele Preis 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a SERVAGel ™ Tris-Glycin Gele – 2D-Gele SERVAGel ™ Tris-Glycine 2D-Gel, 10 % SERVAGel ™ Tris-Glycine 2D-Gel, 12 % SERVAGel ™ Tris-Glycine 2D-Gel, 14 % SERVAGel ™ Tris-Glycine 2D-Gel, 8 – 16 % Kat.-Nr. 43225.01 43226.01 43227.01 43228.01 Probentaschen 1 2D-Tasche 1 2D-Tasche 1 2D-Tasche 1 2D-Tasche Menge 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele Preis 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a SERVAGel ™ Neutralgele Kat.-Nr. 43222.01 43220.01 43223.01 43221.01 Probentaschen 10 Taschen 12 Taschen 10 Taschen 12 Taschen Menge 10 Gele 10 Gele 10 Gele 10 Gele Preis 120,00 a 120,00 a 120,00 a 120,00 a SERVAGel Tris-Glycine 4 – 12 % ™ SERVAGel ™ Tris-Glycine 4 – 20 % SERVAGel ™ Tris-Glycine 8 – 16 % SERVAGel Neutralgel pH 7.4 ™ SERVAGel ™ Neutralgel pH 7.4 Gradient www.serva.de 13 S ERVA ICPL ™ Quadruplex Kit – Jetzt mit viertem Label „ICPL™ QUADRUPLEX Technology for Der alleinige Lizenzhalter der ICPL -Technologie ist die ™ TopLab GmbH, Martinsried. SERVA Electrophoresis GmbH hat von TopLab die weltweiten Vertriebsrechte erhalten und mit der Bruker Daltonic GmbH, Bremen, eine weltweite Vertriebspartnerschaft vereinbart. Die Software ICPL™Quant wurde am MPI für Biochemie entwickelt und ist quantitative Proteomics“1 – mit diesem Poster wurde das vierte ICPL™-Isotopenlabel (13C2D-Nic-Reagenz, s. Infokasten auf S. 15) im Rahmen der HUPO 2008 in Amsterdam vorgestellt. als Freeware unter www.biochem.mpg.de/en/rg/lottspeich oder www.serva.de erhältlich. Die ICPL™ Methode hat den entscheidenden Vorteil, dass die Markierung auf der Ebene intakter Proteine erfolgt und somit vorliegende ICPL™ Quadruplex Kit: Workflow Vergleichende Analyse vier unterschiedlicher Zelltypen oder -phasen Proteinspezies (Isoformen, Abbauprodukte, posttranslational modifizierte Proteinformen etc.) unterschieden werden. Wegen der unterschiedlichen Massen der verschiedenen ICPL™Label wird die quantitative Information einfach Zelltypen / Zellphase 1 Zelltypen / Zellphase 2 Zelltypen / Zellphase 3 Zelltypen / Zellphase 4 durch die Analyse der (LC)-MS Spektren erhalten. Nach der Publikation von Schmidt et Denaturierung und Alkylierung al.2 im Jahr 2005 wurde die „ICPL™ DUPLEX“und sehr bald danach von Kellermann et al.3 die „ICPL™ TRIPLEX“-Methodik zur vergleichenden Analyse von bis zu drei Proben eingesetzt. Als Isotopenmarkierung neueste Entwicklung können Sie jetzt mit der „ICPL™ QUADRUPLEX“-Technologie bis zu vier Proben gleichzeitig quantifizieren. Poolen der Proben Datenauswertung mit ICPL™Quant – kostenlos mit Ihrem ICPL™-Kit Zur Auswertung von LC/MS-Daten ICPL™markierter Proteine wurde durch die Arbeits- Fraktionierung der Proteine (elektrophoretisch, chromatographisch) gruppe Lottspeich am MPI für Biochemie in Martinsried die Software ICPL™Quant 4 entwickelt und ebenfalls erstmals auf der HUPO 2008 in Amsterdam vorgestellt. Enzymatischer Verdau der Proteine in Peptide Fraktionierung der Peptide Massenspektrometrische Analyse, Identifikation, Quantifizierung 14 Die Software erlaubt die „One Button“Analyse der massenspektrometrischen Daten. Dabei werden die ICPL™gelabelten Peptidsets (Duplex, Triplex, Quadruplex) automatisch erkannt und, unter Berücksichtigung der LC-Elutionsprofile und des Isotopeneffektes, quantifiziert. ICPL™Quant selektiert auf Wunsch regulierte Peptide für eine MS/MS Identifikation, generiert VorläuferErgebnislisten für die MS/MS und reimportiert die Mascot Ergebnislisten zur Kombination mit den Quantifizierungsergebnissen. Dieses Vorgehen erspart die redundante, zeit- und kostspielige Re-Identifizierung von bereits bekannten Peptiden. Alle Daten können aus ICPL™Quant in Excel™ -Tabellen exportiert werden. Referenzen 1 Halder, T.M a ., Dosch, D.b, Kersten, M.a, Brunner, A.b, Keidel, E.b, Müller, B.c, Kellermann, J. b und Lottspeich, F.b, ICPL (Isotope-Coded Protein Labeling) Quadruplex Technology for quantitative Proteomics, HUPO 2008 P-MON-289. 2 Schmidt, A.b, Kellermann, J.b, Lottspeich, F.b, A novel strategy for quantitative proteomics using isotope-coded protein labels, Proteomics 2005, 5 [1], 4-15. 3 Kellermann, J.b, Lottspeich, F.b, Keidel, E.b, Jabs, W.d, Hahner, S.d, Brand, S.d, Suckau, D.d, Non-Isobaric TriplexLabeling for Proteomics Strategies Compatible with Protein Pre-fractionation, ABRF 2006, P160-S. 4 Brunner, A.b, Dosch, D.b, Wright, P.C.e, Kellermann, J.b, Lottspeich, F.b, ICPL Quant – a New Software Tool for Isotopelabeling Based Proteomics and Biomarker Discovery, HUPO 2008, P-TUE-143. a TopLab GmbH b Max-Planck-Institut für Biochemie, Martinsried c SERVA Electrophoresis GmbH d Bruker Daltonik GmbH e University of Sheffield Hinweis: Die Poster 1, 3 und 4 finden Sie als Download unter www.serva.de Isotopenlabel Formel Massendifferenz 1-(12C6 1H4 )-Nicotinoyloxy-succinimide (12C-Nic-Reagent): Mr = 105.0215 Da 0 1-(12C6 2D4 )-Nicotinoyloxy-succinimide (2D-Nic-Reagent): Mr = 109.0715 Da 4 1-(13C6 1H4 )-Nicotinoyloxy-succinimide (13C-Nic-Reagent): Mr = 111.0419 Da 6 1-(13C62D4 )-Nicotinoyloxy-succinimide (13C 2D-Nic-Reagent): Mr = 115.0919 Da 10 Produkt SERVA ICPL™ Kit SERVA ICPL™ Triplex Kit SERVA ICPL™ Quadruplex Kit www.serva.de Kat.-Nr. 39230.01 39231.01 39232.01 Menge 2 x 6 Reaktionen 3 x 6 Reaktionen 4 x 6 Reaktionen Preis 1.095,00 a 1.290,00 a 1.490,00 a 15 T rypsin NB – Jetzt mit internem Standard SERVA Trypsin NB Premium Grade wurde speziell für Anwendungen in der Proteomanalyse entwickelt. Es ist insbesondere dafür geeignet, Proteine vor der massenspektrometrischen Analyse in Peptide zu verdauen. Nahezu jedes zu erwartende Trypsin- Um Anforderungen gerecht zu werden, Peptid kann nach Standardverdau eines die für eine interne Kalibrierung trypsin- einzelnen Proteins oder einer komplexen spezifische Standardpeptide benötigen, Proteinmischung gefunden werden. hat SERVA einen Trypsin-Peptid-Stan- Dank eines aufwändigen, eigens dafür dard (TP-Standard, TPS) entwickelt, der entwickelten Produktionsverfahren zeigt die trypsintypischen Massen m / z 842 das SERVA Trypsin NB eine extrem und 2211 darstellt. Der TP-Standard niedrige autoproteolytische Aktivität und erleichtert in einfacher Weise die interne damit eine ausgezeichnete Stabilität Kalibirierung, um die Massengenauigkeit bei gleichzeitig hoher Spezifität und der MS-Analyse zu erhöhen. Durch Reinheit. Konzentrationsveränderung kann der interne Standard unterschiedlichsten experimentellen Anforderungen angepasst werden. Der neue TP-Standard wird bei Trypsin NB Premium Grade, MS approved (Kat.-Nr. 37284) sowie bei Trypsin NB Sequencing Grade (Kat.-Nr. 37283) ohne Aufpreis mitgeliefert. • Trypsin NB Premium Grade für MS-Probenvorbereitung • Trypsin NB jetzt mit internem TP-Standard • Liefert m / z 824 und 2211 für die interne Kalibrierung Produkt Kat.-Nr. Menge Preis Trypsin NB Premium Grade, MS approved 37284.01 4 x 25 μg + TPS 78,00 a Trypsin NB Sequencing Grade 37283.01 4 x 25 μg + TPS 59,00 a 16 14 S ingleQuant – zur Bestimmung der Proteinkonzentration Die Konzentration von Proteinen in Lösung einzelner Proben können Sie jetzt mit dem neuen SingleQuant-Kit einfach und sicher bestimmen. Die eingesetzte Methode (Popov et al., 1975) beruht auf der Bildung von Protein-Amidoschwarz-Farbstoffkomplexen, die durch Fällung einfach und quantitativ isoliert werden können. Nach Waschen des Pellets wird mittels NaOH der gebundene Farbstoff wieder in Lösung gebracht und die SingleQuant Proteinbestimmung: BSA-Eichkurve bestimmt. Die so ermittelten Werte können mittels einer Eichkurve einer definierten Proteinkonzentration zugeordnet werden. A624 nm Konzentration des Farbstoffs bei 624 nm 0,8 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 BSA Standard µg Das System wird nicht durch die Anwesenheit von Detergenzien (z. B. SDS, Nonident P40, CHAPS) oder reduzierenden Reagen- Die einzelnen Punkte stellen den Mittelwert aus drei Einzelbestimmungen inklusive Standardabweichung dar. Die Standardgerade wurde mittels linearer Regressionsanalyse mit der Gleichung y = 0,094 x -0,055 berechnet. Der Regressionskoeffizient R 2 = 0,994. zien (z. B. DTT, ß-ME) gestört. Die Methode liefert genaue und reproduzierbare Messergebnisse und kann innerhalb von 45 Minuten durchgeführt werden. Während SingleQuant optimal abgestimmt ist auf die Bestimmung einzelner Proben erlaubt der auf gleicher Methode basierende ProtaQuant-Kit die Bestimmung von Proteinkonzentrationen im 96-Well-Verfahren. Mit diesem System, das bereits erfolgreich in vielen Labors eingesetzt wird, können Sie in einem Ansatz die Proteinkonzentration von 23 Proben in DreifachBestimmung inkl. Eichkurve eines mitgelieferten Proteinstandards ermitteln. Produkt SingleQuant SingleQuant ProtaQuant Kat.-Nr. 39226.01 39226.02 39225.01 Menge 200 Assays 600 Assays 1 Kit Preis 145,00 a 285,00 a 185,00 a • Bestimmung der Proteinkonzentration von Einzelproben • Einfache, genaue und reproduzierbare Methode • Störungsunanfällig (Detergenzien, reduzierende Reagenzien) • Als ProtaQuant auch für den Hochdurchsatz (96-Well) www.serva.de 17 15 SERVALYT PRECOTES /PreNets und Blank PRECOTES /PreNets – ™ ™ ™ ™ ™ Fertiggele für die horizontale Isoelektrische Fokussierung Fertiggele von SERVA für die horizontale Isoelektrische Fokussierung von Proteinen sind verfügbar in unterschiedlichen pH-Bereichen, in Sollten Sie Fertiggele mit davon abweichenden pH-Bereichen benötigen, können wir Ihnen zwei Alternativen anbieten: verschiedenen Formaten und in unterschiedlichen Gelstärken, stabilisiert durch eine Trägerfolie (GEL-FIX™) oder mittels eines Trägernetzes (NetFix™): SERVALYT™ PRECOTES™ und 1. Sie setzen Blank PRECOTES™ bzw. Blank PreNets™ ein, die Sie zuvor mit einem SERVALYT™ Ihrer Wahl oder einer Mischung verschiedener SERVALYT™ äquilibriert haben. SERVALYT™ PreNets™, die gebrauchsfertigen Gele für die horizontale Isoelektrische Fokussierung. Neben den durch SERVALYT PRECOTES / ™ ™ PreNets™ verfügbaren Bereichen gibt 2. Bei einem größeren Bedarf stellen wir für Sie Gele mit dem gewünschten Gradienten her, wir unterbreiten Ihnen hierzu gerne und kostenlos ein unverbindliches Angebot. es eine hohe Zahl denkbarer pHGradienten für die optimale Trennung Ihrer Proteine. Hier verleihen Ihnen Blank PRECOTES / Blank PreNets Formate ™ Hier können Sie wählen zwischen größtmögliche Flexibilität, da Sie diese 125 x 125 mm und 125 x 245 mm. Bei Gele mit einem pH-Gradienten Ihrer SERVALYT™ PRECOTES™ bildet sich Wahl, aber auch mit Harnstoff etc. der pH-Gradient erst mit Anlegen einer äquilibrieren können. Spannung aus, eine Vorfokussierung ist ™ nicht notwendig. Dies bedeutet, dass Sie pH-Bereiche die Gele entsprechend Ihren Anforde- Sie haben die Wahl zwischen vier unter- rungen beliebig zerteilen können, den schiedlichen pH-Bereichen: „Rest“ bewahren Sie bis zur • 3 – 6, 3 – 10, 4 – 6, 6 – 9 Verwendung im Kühlschrank auf. Diese vier pH-Bereiche decken die Gelstärken meisten Anwendungen ab. Die Gele sind Sie wählen zwischen den Gelstärken frei von Harnstoff oder Detergenzien. Sie 0,15 mm und 0,3 mm. Die etwas können bei Bedarf die Gele z. B. mit dickeren Gele tolerieren mehr Verun- Harnstoff äquilibrieren, wenn Sie eine reinigungen (z. B. Salze) in Ihrer Probe, IEF unter denaturierenden Bedingungen die mit 0,15 mm deutlich dünneren Gele durchführen möchten. Details dazu fin- zeigen je nach Proben ein besseres den Sie in der Bedienungsanleitung Trennverhalten. (siehe www.serva.de). 18 Isoelektrische Fokussierung unter Einsatz von SERVALYT ™ PRECOTES™ Stabilisierung durch GEL-FIX™ und NetFix™ Alle SERVALYT™ PRECOTES™ sind kovalent mit der Trägerfolie GEL-FIX™ verbunden. Diese Folie stabilisiert das Gel bei der Handhabung und während der Elektrophorese sowie beim Färbeprozess. Beim Trocknen verhindert die Folie, dass das Gel schrumpft. Falls IEF von Proteinen isoliert aus unterschiedlichen Käsesorten IEF von Proteinen isoliert aus unterschiedlichen Fleischsorten IEF von Proteinen isoliert aus unterschiedlichen Kartoffelsorten IEF von Proteinen isoliert aus unterschiedlichen Weizensorten Sie Ihre getrennten Proteine später blotten möchten, können Sie GEL-FIX™stabilisierte Gele nicht verwenden, da die Trägerfolie isolierend für den Stromfluss wirkt. Für diese Anwendung wurden die SERVALYT™ PreNets™ entwickelt. SERVALYT™ PreNets™ sind stabilisiert durch NetFix , ein netzartiges ™ Material, das in die Gele bei der Herstellung eingegossen wird. Das Netz sorgt jetzt ähnlich wie GEL-FIX™ für eine Stabilisierung der Gelmatrix, ist aber durchlässig. Produkt SERVALYT™ PRECOTES™ pH 3 – 10 SERVALYT™ PRECOTES™ pH 3 – 6 SERVALYT™ PRECOTES™ pH 4 – 6 SERVALYT™ PRECOTES™ pH 6 – 9 SERVALYT™ PreNets™ pH 3 – 10 SERVALYT™ PreNets™ pH 4 – 6 Blank PRECOTES™ Blank PreNets™ www.serva.de Grösse (in mm) 125 x 125 x 0,15 125 x 245 x 0,15 125 x 125 x 0,3 125 x 245 x 0,3 125 x 125 x 0,15 125 x 245 x 0,15 125 x 125 x 0,3 125 x 125 x 0,3 125 x 125 x 0,15 125 x 125 x 0,3 125 x 125 x 0,3 125 x 125 x 0,3 125 x 125 x 0,3 245 x 125 x 0,3 125 x 125 x 0,3 Kat.-Nr. 42965.03 42967.02 42866.02 42867.02 42974.02 42919.03 42874.02 42875.02 42978.02 42878.02 42738.02 42748.02 42759.01 42710.01 42758.01 Menge 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele 5 Gele Preis 166,00 a 229,00 a 166,00 a 229,00 a 166,00 a 229,00 a 166,00 a 166,00 a 166,00 a 166,00 a 208,00 a 208,00 a 97,00 a 139,00 a 107,00 a 19 News Kundenzeitschrift der SERVA Electrophoresis GmbH Wir sind für Sie da! Headquarters SERVA Electrophoresis GmbH • Carl-Benz-Str. 7 • D-69115 Heidelberg SERVA Electrophoresis GmbH • Pinnauallee 4 • D-25436 Uetersen E-Mail: info@serva.de • Internet: www.serva.de Für Deutschland Für Österreich Bestellannahme Telefon: 06221 13840 - 0 Fax: 06221 13840 -10 Telefon (gebührenfrei): 0800 7378246 Fax (gebührenfrei): 0800 7378247 Bestellannahme Telefon: 07472 234-23 0676 840 418-445 Fax: 07472 234-234 E-Mail: office@al-labor.at Kundenservice Telefon: 06221 13840 - 47 Fax: 06221 13840 -10 Kundenservice Telefon: 07472 234-23 Fax: 07472 234-234 Technischer Service Telefon: 06221 13840 - 44 Fax: 06221 13840 - 54 E-Mail: tech.service@serva.de Technischer Service Telefon: +49 6221 13840-44 Fax: +49 6221 13840-54 E-Mail: tech.service@serva.de Technischer Service Kollagenase Telefon: 04122 712 - 413 Fax: 04122 712 - 286 E-Mail: collagenase@serva.de Technischer Service Kollagenase Telefon: +49 4122 712-413 Fax: +49 4122 712-286 E-Mail: collagenase@serva.de Impressum SERVA News Kundenzeitschrift der SERVA Electrophoresis GmbH Carl-Benz-Str. 7 D-69115 Heidelberg Verantwortlich für den Inhalt SERVA Electrophoresis GmbH Layout acrobat.werbeagentur, Hamburg Druck ABT Print und Medien GmbH, Weinheim © SERVA Electrophoresis GmbH, 2008