Karolina Gullsby, Fynd av Bordetella holmesii
Transcription
Karolina Gullsby, Fynd av Bordetella holmesii
Detektion av Bordetella holmesii – den som söker den finner! Equalis användarmöte för Medicinsk mikrobiologi 12 mars 2015 Karolina Gullsby, molekylärbiolog, Klinisk mikrobiologi, Gävle sjukhus regiongavleborg.se Bordetella species Species Upptäcktsår B. pertussis 1906 Luftvägspatogen Endast människa B. bronchiseptica 1912 Luftvägspatogen Däggdjur, bla. hund, sällsynt hos människa B. parapertussis 1938 Luftvägspatogen Människa och får B. avium 1984 Luftvägspatogen Höns B. hinzii 1994 Luftvägspatogen Höns B. holmesii 1995 Invasiva infektioner, luftvägsinfektion Endast människa B. trematum 1996 Sår- och öron-infektioner Människa B. petrii 2000 Miljöbakterie? Hittad i bioreaktor, fall hos CFpatient, septisk artrit 2005 ? Isolerad hos människa B. ansorpii regiongavleborg.se Diagnostik av B. pertussis/B. parapertussis • Gick över från odling till PCR år 2006 - högre känslighet! • Analyserar dagligen må-fre (prover från Uppsala, Dalarna, Gävleborgs län) • 2014 kraftig ökning av B. pertussis • PCR-metod baserad på IS-sekvenser (IS481, IS1001) regiongavleborg.se Differentiering Bordetella sp. IS-sekvenser IS481 IS1001 IS1001-likn. B. pertussis + - - B. parapertussis - + - B. holmesii + - + ((+)) ((+)) - B. bronchiseptica regiongavleborg.se PCR-diagnostik mikrobiologen Gävle ref. Templeton et al. J Clin Microbiol 2003, modifierad! IS481 IS1001+IS1001-likn. B. pertussis + - B. parapertussis - + B. holmesii + + regiongavleborg.se PCR-diagnostik mikrobiologen Gävle IS481 IS1001+IS1001-likn. B. pertussis + - B. parapertussis - + B. holmesii + + ((+)) ((+)) B. pertussis + B. parapertussis + + B. pertussis + B. holmesii + + B. bronchiseptica regiongavleborg.se Fall 1 B. holmesii-fynd i nph • • • • • • 44-årig kvinna, tidigare elitidrottare, inga bakomliggande sjukdomar Kvinnan haft övre luftvägsinfektion 4 veckor sedan 2 veckor med kikhostesymptom – besökte hälsocentralen Ingen feber, CRP < 5 Dottern hostat flera veckor men nu bra Prov för B. pertussis-PCR togs 141114 PCR mot B. pertussis/B. parapertussis kördes 141119 regiongavleborg.se Ct 15,9 (IS481) Ct 16,2 (”IS1001”) regiongavleborg.se Fall 1 B. holmesii-fynd i nph forts. • Telefonkontakt med kliniker ”Misstänkt B. holmesii utredning pågår” • Odling Charcoal agar-platta + buljong (totalt 7 dagar) • Pertussis-liknande växt • MALDI-ToF: B. holmesii! • Patienten frisk – ingen behandling regiongavleborg.se regiongavleborg.se PCR-verifiering av patientfynd 1 IS481* B. pertussis kontroll B. parapertussis kontroll Patientprov 26,1 IS1001* IS1001likn.* - ptxA* porA** 35,9 30,4 - 24,05 - 31,6 - 17,9 - 14,4 - - *) Ref. Pittet et al. PLoS One 2014 **) Ref. Hasan et al. Can J Infect Dis Med Microbiol 2014 regiongavleborg.se Fall 2 B. holmesii-fynd i knäpunktat – 141130 • 78-årig man, rökare, RA • Fått knäprotes januari 2014 – problem med svullnader hela tiden • November 2014 svullnad och ont, får gå med kryckor • 141130 knäpunktat odlat på flaska regiongavleborg.se Fall 2 B. holmesii-fynd i knäpunktat – forts. • • • • Flaska larmar efter 2 dygn Växt ”pytte grön” dag 1 (dp = g-stav) MALDI-ToF: B. holmesii PCR-positiv i vår metod för IS481 och ”IS1001” regiongavleborg.se Tack! Frågor? regiongavleborg.se